Родился в Аргентине, окончил консерваторию Gilardo Gilardi по классу органа. В 1992 году получил степень магистра музыки в Йельском университете под руководством Томаса Мюррея. Обладатель высшей награды, присуждаемой органисту (Йельский университет), стипендии Чарлза Айвза и премии Джулии Шерман за выдающиеся достижения в органном искусстве. Среди других наград — стипендия Э. Пауэра Биггса и стипендия Вивиан Э. Смит. В мае 2006 года получил степень доктора музыкальных искусств в Бостонском университете. Среди учителей такие выдающиеся личности, как Гарольд Фогель, Мари-Клер Ален, Чарльз Кригбаум, Пит Кее, Рафаэль Феррейра, Энрике Римольди, Адельма Гомес, Виктор Урбан, Джеймс Дэвид Кристи и Томас Мюррей.

Концертирует по Европе и Америке, включая выступления на национальных и региональных съездах Американской гильдии органистов, Исторического органного общества и Национального съезда соборных музыкантов. Выступал в качестве солиста с Хартфордским симфоническим оркестром, Orquesta Estable del Teatro Argentino, Симфоническим оркестром Нью-Хейвена, Orquesta Estable del Teatro Colón, Orquesta de Cámara de la Municipalidad de La Plata и Симфоническим оркестром школы Хартта. Был судьёй нескольких национальных и международных конкурсов, включая Региональный конкурс Американской гильдии органистов и Международный конкурс органистов (Калининград, Россия).

В 2018 году присоединился к преподавательскому составу Колледжа Святого Креста в качестве профессора и выдающегося резидента-органиста. Помимо преподавания, является куратором знаменитого органа Taylor and Boody Opus 9 в часовне памяти Святого Иосифа, а также руководителем известной серии концертов артистов часовни.

Среди знаковых записей — «Французская музыка в соборе Святого Иосифа» и Ezequiel Menéndez LIVE, включающая музыку добаховской эпохи, записанную в Колледже Святого Креста.

В 2009 году стал почётным исполнителем органных сонат Мендельсона в честь 200-летия композитора в Гарвардском университете.

Записал более пятисот часов музыки для потокового вещания и трансляции литургий для архиепархии Хартфорда.

Когда доктор музыкальных искусств Менендес находится не за пультом органа, он любит играть в четыре руки на фортепиано со своей женой Мерседес, навещает своих четверых детей и трёх внуков и плавает на любимой лодке Moondust.